Mahiro Yasaka is een gewone middelbare scholier, totdat hij op een dag plotseling wordt aangevallen door een gevaarlijk monster. Net wanneer alles verloren lijkt te zijn, wordt hij gered door een vreemd meisje genaamd Nyaruko, die beweert de van vorm veranderende godheid Nyarlathotep te zijn uit Cthulhu Mythos van horrorauteur H.P. Lovecraft.
